摇床（又称振荡器）是液体菌种振荡培养的常用设备。根据摇床的运动形式可分为两种：一种是往复式摇床，另一种是旋转式摇床。其作用都在于通过振动，增大培养液与空气的接触面，有利于氧气的溶解，为菌丝生长提供必要的生活条件。此外，还有利于在振荡过程中，通过机械力的冲击、切割作用，使生长中的菌丝体断裂为菌丝碎片，并在一定转速的控制下，形成分散性的菌丝球。

摇床溶解氧的多少与摇床的振幅、频率、装液量和空气过滤介质,等因素有关联。一般说，装液量越少，振幅（或偏心距）越大，频率越高，氧的溶解效果越好。根据偏心距的大小，旋转式摇床的振荡频率可控制在40～300r/min，通常在220r/min;往复式摇床的往复距离（冲程）为8～12cm，振荡频率为80～120r/min。故在液体菌种生产中，更多的是使用旋转式的摇床。